Ngày 18/9/2026, Thuế Thành phố Hà Nội ban hành Công văn số 47199/HAN-QLDN5 hướng dẫn thực hiện chính sách thuế về các khoản giảm trừ thu nhập chịu thuế thu nhập cá nhân (TNCN) đối với các khoản chi cho y tế và giáo dục, áp dụng từ ngày 1/7/2026.

1. Những khoản chi y tế, giáo dục được giảm trừ khi tính thuế TNCN

Để giúp người lao động cập nhật đầy đủ và kịp thời chính sách thuế TNCN liên quan đến các khoản giảm trừ đối với chi phí y tế, giáo dục – đào tạo, tại Công văn số 47199/HAN-QLDN5, Thuế Thành phố Hà Nội đã tổng hợp các văn bản và hướng dẫn một số quy định quan trọng để các đơn vị triển khai thực hiện.

Cụ thể, Theo Khoản 2, Điều 49, Nghị định 253/2026/NĐ-CP ngày 30/6/2026, người nộp thuế là cá nhân cư trú được giảm trừ các khoản chi cho y tế, giáo dục - đào tạo của người nộp thuế và người phụ thuộc vào thu nhập chịu thuế trước khi tính thuế đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công bao gồm:

• Chi phí khám bệnh, chữa bệnh: Được giảm trừ đối với các khoản chi cho khám bệnh, chữa bệnh tại cơ sở y tế trong nước thuộc phạm vi danh mục do bảo hiểm y tế chi trả tổng không quá 23 triệu đồng/năm;
• Chi phí giáo dục – đào tạo: Được giảm trừ đối với các khoản chi cho giáo dục - đào tạo tại cơ sở giáo dục - đào tạo trong nước tổng không quá 24 triệu đồng/năm. Các khoản chi đảm bảo theo quy định của pháp luật về giáo dục - đào tạo gồm:
• Khoản tiền học phí giáo dục mầm non, giáo dục phổ thông,
• Khoản tiền học phí giáo dục nghề nghiệp và giáo dục đại học;
• Khoản tiền học các kỹ năng chuyên môn khác tại cơ sở giáo dục - đào tạo.

Như vậy, nếu đáp ứng đầy đủ điều kiện, tổng mức giảm trừ tối đa đối với hai nhóm chi phí nêu trên, số tiền được giảm trừ đóng thuế TNCN có thể lên đến 47 triệu đồng/năm.

2. Điều kiện để được giảm trừ chi phí y tế, giáo dục

Công văn 47199/HAN-QLDN5 lưu ý người nộp thuế cần có đầy đủ hồ sơ, chứng từ chứng minh khoản chi phí y tế, giáo dục thực tế. Theo Khoản 3, Điều 49, Nghị định 253/2026/NĐ-CP, các khoản chi được giảm trừ phải đáp ứng các điều kiện chính sau:

• Thứ nhất: Có hóa đơn, chứng từ hợp pháp. Đối với khoản chi y tế, ngoài hóa đơn, chứng từ còn phải có Bảng kê chi phí khám bệnh, chữa bệnh theo quy định của Bộ trưởng Bộ Y tế.
• Thứ hai: Để được giảm trừ hóa đơn, chứng từ phải thể hiện thông tin của người nộp thuế hoặc người phụ thuộc mà khoản chi phát sinh.
• Thứ ba: Không được chi trả từ các nguồn khác, kể cả từ nguồn tài trợ, hỗ trợ, trả thay của tổ chức, cá nhân, nguồn ngân sách nhà nước, quỹ bảo hiểm xã hội, bảo hiểm y tế, bảo hiểm chi trả dưới các hình thức.

Do đó, người lao động cần chủ động lưu giữ hóa đơn, chứng từ và hồ sơ liên quan để chứng minh khoản chi khi thực hiện quyết toán thuế.

3. Một số khoản chi y tế, giáo dục không được giảm trừ trùng

Bên cạnh khoản được giảm trừ chi phí y tế, giáo dục khi tính thuế TNCN đã nêu, Công văn 47199/HAN-QLDN5 cũng làm rõ nguyên tắc tránh giảm trừ hoặc ưu đãi thuế trùng đối với cùng một khoản chi quy định tại Khoản 4, Điều 49, Nghị định 253/2026/NĐ-CP, cụ thể:

• Trường hợp khoản chi y tế thuộc diện được giảm thuế do bệnh hiểm nghèo theo Điều 40, Nghị định 253/2026/NĐ-CP thì khoản chi này không tiếp tục được tính vào khoản giảm trừ chi phí y tế theo Điều 49.
• Không tính vào các khoản giảm trừ chi phí y tế, giáo dục khi tính thuế TNCN đối với trường hợp phát sinh các khoản chi cho y tế, giáo dục - đào tạo sau:
  • Khoản tiền hỗ trợ của người sử dụng lao động cho việc khám bệnh, chữa bệnh hiểm nghèo cho bản thân người lao động và thân nhân của người lao động. Mức hỗ trợ không tính vào thu nhập chịu thuế là số tiền người sử dụng lao động hỗ trợ thực tế theo hóa đơn, chứng từ nhưng tối đa không quá số tiền trả viện phí của người lao động và thân nhân người lao động sau khi đã trừ số tiền chi trả của tổ chức bảo hiểm (nếu có).
  • Khoản tiền học phí cho con của người lao động nước ngoài học tại Việt Nam, con của người lao động Việt Nam đang làm việc ở nước ngoài học tại nước ngoài theo bậc học từ mầm non đến trung học phổ thông do người sử dụng lao động trả thay (hoặc thanh toán) cho người lao động;
  • Khoản chi do người sử dụng lao động trả thay tiền đào tạo nâng cao trình độ, tay nghề cho người lao động phù hợp với công việc chuyên môn, nghiệp vụ của người lao động hoặc theo kế hoạch của người sử dụng lao động.

Quy định này nhằm hạn chế việc một khoản chi được hưởng đồng thời nhiều cơ chế ưu đãi khi xác định nghĩa vụ thuế TNCN.

4. Quy định quyết toán thuế TNCN đối với người lao động có khoản giảm trừ chi phí y tế, giáo dục

Công văn 47199/HAN-QLDN5 chỉ rõ trường hợp người lao động có yêu cầu thực hiện giảm trừ vào thu nhập đối với các khoản chi phí giáo dục, y tế nêu trên khi tính thuế thì người nộp thuế không được ủy quyền quyết toán cho cơ quan chi trả, phải tự quyết toán thuế TNCN (quy định tại Khoản 3, Điều 51, Nghị định 253/2026/NĐ-CP).

Người lao động cần phân biệt khoản giảm trừ chi phí y tế, giáo dục với các khoản giảm trừ thông thường đã được tổ chức trả thu nhập thực hiện khi khấu trừ thuế, theo đó xác định nghĩa vụ quyết toán thuế TNCN.

5. Đơn vị y tế, giáo dục cần bảo đảm hóa đơn, chứng từ

Công văn 47199/HAN-QLDN5 đồng thời lưu ý các đơn vị hoạt động trong lĩnh vực y tế, giáo dục – đào tạo về việc thực hiện đúng quy định về hóa đơn, chứng từ.

• Đối với cơ sở khám bệnh, chữa bệnh, việc lập bảng kê chi phí khám bệnh, chữa bệnh là một trong những hồ sơ quan trọng để người nộp thuế chứng minh khoản chi đủ điều kiện giảm trừ.
• Theo Quyết định 697/QĐ-BYT năm 2026, trường hợp cơ sở khám bệnh, chữa bệnh đã triển khai bệnh án điện tử có thể lập bảng kê chi phí dưới dạng điện tử và cung cấp cho người bệnh qua phương tiện điện tử; bảng kê điện tử có ký số đầy đủ có giá trị tương đương bản giấy.

Ngoài ra, doanh nghiệp cần phối hợp phổ biến chính sách cho người lao động, đồng thời hướng dẫn việc cung cấp và lưu trữ hồ sơ, hóa đơn, chứng từ liên quan theo quy định phục vụ cho quyết toán thuế TNCN. Việc lập hóa đơn, chứng từ và bảng kê đúng quy định không chỉ là yêu cầu đối với cơ sở cung cấp dịch vụ mà còn tạo cơ sở để người nộp thuế thực hiện quyền giảm trừ khi quyết toán TNCN.

Như vậy, Công văn 47199/HAN-QLDN5 ngày 18/9/2026 giúp làm rõ quy định về chính sách giảm trừ đối với một số khoản chi y tế và giáo dục – đào tạo khi xác định thu nhập chịu thuế TNCN. Người lao động có thu nhập từ tiền lương, tiền công cần đặc biệt lưu ý giới hạn 23 triệu đồng/năm đối với chi phí y tế và 24 triệu đồng/năm đối với chi phí giáo dục – đào tạo, đồng thời đảm bảo đầy đủ hóa đơn, chứng từ và điều kiện giảm trừ. Đồng thời, các doanh nghiệp cũng cần cập nhật hướng dẫn mới để thông tin đầy đủ cho người lao động, hạn chế sai sót trong quá trình khấu trừ và quyết toán thuế TNCN.

Thu Hương.